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NEMD设置热浴,将nvt修改成langevin需要注意的事项(热流都为正数的问题处理)

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  上图是NEMD计算使用NVT进行热浴的设置,需要注意的是在进行fix nve时,需要排除固定的部分和热源热汇部分,不然会导致热流都为正数 而使用langevin热浴时,需要将fix nve这一步将所有原子包括进去,即fix all,同时在设置langevin热浴计算时需要加上随机seed以及tally yes,详情在上图中可以了解