LAMMPS运行过程中发现结构跑散的问题
在使用EMD跑热导率的时候,dump文件的轨迹非常离谱,gif图如下:
跑完发现结构散架了,经过调查发现在NVT弛豫的时候结构就散架了,然后检查LOG文件发现:在这里把热浴的参数修改一下,把1修改成0.1或0.005就可以了,
但是这里修改了之后确实发现log中温度能够较好的保持在300K左右
但是我转念一想,可能是自己哪里设置错了,我想到了势函数的原子顺序是非常重要不能反顺序的,然后我想到自己data文件的原子顺序和构造势函数的时候原子顺序不一样,然后我修改了一下data文件,再跑了一遍发现好像成了😤
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