LAMMPS运行过程中发现结构跑散的问题
在使用EMD跑热导率的时候，dump文件的轨迹非常离谱，gif图如下： 跑完发现结构散架了，经过调查发现在NVT弛豫的时候结构就散架了，然后检查LOG文件发现： 设置的温度为300K但是这里温度却突然跳到了9000多开，这应该就是结构散架的可能原因， 在这里把热浴的参数修改一下，把1修改成0.1或0.005就可以了， 但是这里修改了之后确实发现log中温度能够较好的保持在300K左右 但是通过dump轨迹文件发现，结构还是散掉了，难道就是构造的势函数出问题了吗？？ 我不禁陷入怀疑，寄了啊😭 但是我转念一想，可能是自己哪里设置错了，我想到了势函数的原子顺序是非常重要不能反顺序的，然后我想到自己data文件的原子顺序和构造势函数的时候原子顺序不一样，然后我修改了一下data文件，再跑了一遍发现好像成了😤
